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超維知藥,以數(shù)據(jù)科學(xué)為支點(diǎn)驅(qū)動(dòng)臨床前藥物發(fā)現(xiàn)

近日,國(guó)家藥品監(jiān)督管理局藥品評(píng)審中心公布了《以臨床價(jià)值為導(dǎo)向的抗腫瘤藥物臨床研發(fā)指導(dǎo)原則(征求意見稿)》,從指導(dǎo)原則可以看出針對(duì)國(guó)內(nèi)創(chuàng)新藥靶點(diǎn)扎堆、“Me-too”泛濫、低水平重復(fù)、缺乏真正的創(chuàng)新等問題,創(chuàng)新藥政策收緊,倒逼產(chǎn)業(yè)向“Me-better”轉(zhuǎn)型。

更高質(zhì)量、更具創(chuàng)新性的藥物才是未來(lái)的研發(fā)主流。其中,最難的是源頭創(chuàng)新,積極運(yùn)用新技術(shù)助力藥物研發(fā),解決藥研的痛點(diǎn)問題,才能使中國(guó)藥研產(chǎn)業(yè)實(shí)現(xiàn)彎道超車。然而,新技術(shù)的融合碰撞異常艱難,在產(chǎn)業(yè)落地上更存在未解之痛。

怎樣才能克服這些困難?帶著這些疑問,動(dòng)脈網(wǎng)有幸采訪了北京超維知藥科技有限公司(以下簡(jiǎn)稱超維知藥)聯(lián)合創(chuàng)始人兼CEO秦炳杰博士,來(lái)看看超維知藥對(duì)于這些問題是如何解決的。

相識(shí)兩個(gè)月,他們決定一起探索新領(lǐng)域

動(dòng)脈網(wǎng):能簡(jiǎn)單分享一下您創(chuàng)辦公司之前的經(jīng)歷嗎?

秦博士:從2003年到2019年,我在軍科院一直開展創(chuàng)新藥物研發(fā)工作。期間博士學(xué)位是由軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院和巴黎第七大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)的,在軍科院主要研究藥化領(lǐng)域,在巴黎第七大學(xué)主要研究計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)領(lǐng)域,17年求學(xué)和工作經(jīng)歷為創(chuàng)業(yè)奠定了專業(yè)基礎(chǔ)。

動(dòng)脈網(wǎng):您之前的主要研究方向還是偏向于藥學(xué)領(lǐng)域,而另一位創(chuàng)始人曹晨磊博士則是完全的偏向于計(jì)算機(jī)領(lǐng)域,您們兩個(gè)之前毫無(wú)關(guān)系的人是如何認(rèn)識(shí)并決定一起創(chuàng)業(yè)的呢?

秦博士:我跟曹博之間的故事比較有趣。曹博是北京郵電大學(xué)密碼編碼方向的博士,曾參與多個(gè)國(guó)家重大專項(xiàng),之前有過創(chuàng)業(yè)經(jīng)歷,就職于大唐電信期間曾引導(dǎo)公司在AI方向?qū)崿F(xiàn)了零的突破。

按常理說(shuō),這樣兩個(gè)學(xué)科背景的人很難有交集。我從軍科院出來(lái)的時(shí)候就對(duì)AI藥研很感興趣,覺著是未來(lái)的技術(shù)方向,因此加入了元?dú)庵幍腁I部門(超維知藥前身),進(jìn)去后發(fā)現(xiàn)身邊小伙伴的專業(yè)背景都是計(jì)算機(jī)化學(xué)和生物信息學(xué),計(jì)算機(jī)與數(shù)據(jù)科學(xué)能力匱乏,急尋一位在計(jì)算科學(xué)領(lǐng)域有資深經(jīng)驗(yàn)、具備跨學(xué)科能力的伙伴加入。

剛好曹博也在尋求藥研方向的新機(jī)會(huì),當(dāng)時(shí)國(guó)內(nèi)耕耘這個(gè)領(lǐng)域的靠譜公司很少,這也促成了我們?cè)?9年聚到一起。彼時(shí)曹博就職于大唐電信,辦公地點(diǎn)就隔了一條馬路,我們每周交流兩三次。當(dāng)時(shí)元?dú)庵幐獨(dú)馍滞瑢僖患,曹博過來(lái)討論問題時(shí)都能趕上免費(fèi)“蹭喝”元?dú)獾男庐a(chǎn)品,幫他們改良產(chǎn)品體驗(yàn),在學(xué)科碰撞之余還平添了很多歡樂。

那段時(shí)間,我們深入探討了藥物發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域的諸多科學(xué)難題。他問我藥學(xué)知識(shí),我問他算法知識(shí)。兩個(gè)月后,我問他,你要不要過來(lái)一起試試?他說(shuō)做AI密碼編碼分析很難落地,對(duì)人類貢獻(xiàn)低,覺得雖然AI藥研難度更大,挑戰(zhàn)性更強(qiáng),但社會(huì)意義非凡,值得投身其中?傮w來(lái)說(shuō),兩個(gè)專業(yè)領(lǐng)域跨越非常大,前期的團(tuán)隊(duì)磨合十分艱難,但我們憑著對(duì)這個(gè)領(lǐng)域的理想與執(zhí)著,建立了超維知藥的科研團(tuán)隊(duì)與技術(shù)體系。

超維分子表征體系打造技術(shù)壁壘

動(dòng)脈網(wǎng):您剛剛提到學(xué)科的跨越十分大,超維知藥具體有哪些交叉學(xué)科集結(jié)的技術(shù)團(tuán)隊(duì)呢?

秦博士:公司技術(shù)團(tuán)隊(duì)融合了藥物化學(xué)、計(jì)算化學(xué)、數(shù)學(xué)、生物、計(jì)算機(jī)等多個(gè)學(xué)科的專家,半數(shù)具有海外學(xué)習(xí)和工作背景,博士、碩士占比超70%。我們利用AI技術(shù)探索分子宇宙空間,基于分子圖結(jié)構(gòu)打造了集藥物分子虛擬篩選、結(jié)構(gòu)優(yōu)化、成藥性評(píng)價(jià)等能力于一體的創(chuàng)新藥發(fā)現(xiàn)及優(yōu)化系統(tǒng),致力于提升藥物發(fā)現(xiàn)效率與成功率,縮短研發(fā)時(shí)間,降低研發(fā)成本和風(fēng)險(xiǎn)。

動(dòng)脈網(wǎng):在這樣高壁壘的多學(xué)科交叉背景下,超維知藥的分子表征體系具體擁有哪些特征呢?

秦博士:藥物分子有無(wú)限的化學(xué)空間,要在龐大的化學(xué)空間中找到成藥空間,關(guān)鍵在于如何“看”這個(gè)化學(xué)宇宙——即對(duì)化學(xué)空間的多維表征。傳統(tǒng)方式是基于幾種人類專家構(gòu)建的簡(jiǎn)單特征去刻畫化學(xué)空間,導(dǎo)致呈現(xiàn)效果模糊,無(wú)區(qū)分能力。

超維知藥自主研發(fā)的分子表征體系,綜合運(yùn)用了群論、矩陣論、拓?fù)鋵W(xué)等相關(guān)數(shù)學(xué)理論,基于十億級(jí)已合成分子庫(kù)訓(xùn)練分子特征提取模型,在保證分子特征提取無(wú)誤的前提下,將基于圖結(jié)構(gòu)的原始分子信息映射到一個(gè)高維流形空間中,得到分子的深度表征信息。在篩選過程中,以某靶點(diǎn)已知hits分子的深度表征信息為錨點(diǎn),即可精準(zhǔn)定位到對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)的活性分子空間區(qū)域。之后,再結(jié)合ADMET模型評(píng)價(jià),得到兼具高活性和良好成藥性質(zhì)的PCC Drug。

超維知藥的分子表征體系具有覆蓋度廣、分辨率高、可擺脫人類專家經(jīng)驗(yàn)束縛、具有靶點(diǎn)或者其它性質(zhì)聚類效果、可結(jié)合強(qiáng)化學(xué)習(xí)技術(shù)探索未知化學(xué)空間等特點(diǎn)。

超維.png

超維知藥智能藥物設(shè)計(jì)流程

看起來(lái)“高大上”,實(shí)際上“苦累臟”,只有這家公司在做

動(dòng)脈網(wǎng):目前同類型的企業(yè)多嗎?

秦博士:其實(shí)這些技術(shù)可能聽起來(lái)“高大上”,實(shí)際上卻是一個(gè)“苦累臟“的差事。據(jù)我從公開報(bào)道的文獻(xiàn)和新聞中了解,國(guó)內(nèi)外還沒有同類型企業(yè)將這些技術(shù)做到產(chǎn)業(yè)落地的水平。這些技術(shù)需要綜合多學(xué)科領(lǐng)域知識(shí),我們集結(jié)了五六個(gè)不同專業(yè)的博士,聚全公司之力花了7個(gè)多月才完成初版。沒有前人經(jīng)驗(yàn)可借鑒,我們自己從底層入手,一行一行地敲代碼,數(shù)以萬(wàn)計(jì)地反復(fù)修正、試錯(cuò),才打造出這個(gè)體系。

在我看來(lái),這不是產(chǎn)業(yè)問題,而是科學(xué)問題,對(duì)于一些公司來(lái)說(shuō),很少愿意去做科學(xué)問題,這也是我們的核心競(jìng)爭(zhēng)力。

動(dòng)脈網(wǎng):目前超維知藥如何擴(kuò)展市場(chǎng)呢?都與哪些機(jī)構(gòu)或企業(yè)有了合作?

秦博士:我們擴(kuò)展市場(chǎng)有兩種方式,一種是我們走出去,另一種是別人走進(jìn)來(lái)。在20年初的起步階段,我們主動(dòng)找了一些有藥研需求且研究領(lǐng)域相符的企業(yè)上門交流尋求合作。時(shí)至今日,已經(jīng)有很多企業(yè)慕名而來(lái)主動(dòng)尋求與我們合作。我們已經(jīng)承接了10多個(gè)項(xiàng)目,團(tuán)隊(duì)的項(xiàng)目承接能力已幾近飽和,導(dǎo)致很多找上門的項(xiàng)目無(wú)法排期,我們正在積極地招募、擴(kuò)大團(tuán)隊(duì)。

合作方面,我們已與軍科院、北京協(xié)和藥物研究所、齊魯制藥、晶蛋生物、光武生物、鷺港生物等多家機(jī)構(gòu)和企業(yè)建立了合作關(guān)系。

動(dòng)脈網(wǎng):那這樣一個(gè)項(xiàng)目交付周期具體有多長(zhǎng)呢?

秦博士:從委托公司給我們一個(gè)靶點(diǎn),拿到靶點(diǎn)啟動(dòng)數(shù)據(jù)調(diào)研立項(xiàng)開始計(jì)時(shí),到我們給出實(shí)體化合物結(jié)束,整個(gè)周期不到兩個(gè)月。在知識(shí)產(chǎn)權(quán)保護(hù)方面,我們向委托公司提供獨(dú)占靶點(diǎn)保護(hù),在雙方約定的時(shí)間內(nèi)不再開發(fā)相同靶點(diǎn)。

致力成為中國(guó)新一代以數(shù)據(jù)科學(xué)為支點(diǎn)的創(chuàng)新藥孵化器

動(dòng)脈網(wǎng):目前超維知藥的整體戰(zhàn)略布局是如何的呢?

秦博士:前期我們主要以藥物研究技術(shù)服務(wù)為主,與藥企和科研院所合作,提供從苗頭化合物到候選化合物的篩選及優(yōu)化服務(wù),保證IP100%屬于委托方。中期逐步拓展藥物合作開發(fā)業(yè)務(wù),針對(duì)具體項(xiàng)目以技術(shù)入股或資金入股形式共同開發(fā),IP由雙方共同持有。后期以自研管線為主,將藥物IP轉(zhuǎn)讓給藥企,轉(zhuǎn)讓前IP100%屬于公司。

動(dòng)脈網(wǎng):那目前超維知藥有哪些主要需求呢?

秦博士:公司2020年5月成立,8月獲淳信長(zhǎng)贏1000萬(wàn)天使投資后,主要是組建團(tuán)隊(duì)和技術(shù)研發(fā)。經(jīng)前期項(xiàng)目打磨、我們已驗(yàn)證了技術(shù)體系的可行性和產(chǎn)業(yè)價(jià)值,接下來(lái)最主要的需求是擴(kuò)大研發(fā)團(tuán)隊(duì)、建立超維自有的化學(xué)合成與生物評(píng)價(jià)實(shí)驗(yàn)室、穩(wěn)步推進(jìn)自研藥物管線,打造IP產(chǎn)出閉環(huán)。

動(dòng)脈網(wǎng):最后,想請(qǐng)您介紹一下“超維知藥”名字的含義和未來(lái)公司發(fā)展的愿景。

秦博士:“超維”是一個(gè)計(jì)算機(jī)領(lǐng)域的詞,表示運(yùn)用數(shù)學(xué)手段從超高維度去觀察和認(rèn)知世界!爸帯贝碚J(rèn)知、洞察藥物的本質(zhì)。我們希望運(yùn)用新的技術(shù)手段在超高維度探索藥學(xué)領(lǐng)域里更深層次的知識(shí),擺脫人類專家經(jīng)驗(yàn)束縛,探索出一條新的創(chuàng)新藥物研發(fā)道路。

道長(zhǎng)且阻,行則將至,行而不輟,未來(lái)可期,對(duì)此我們充滿信心,公司致力于成為以數(shù)據(jù)科學(xué)為支點(diǎn)、全球領(lǐng)先的創(chuàng)新藥孵化器,為廣大合作伙伴提供高質(zhì)量臨床前項(xiàng)目與化合物資源。

作者:周秋寒

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