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微醫(yī)原副總裁創(chuàng)業(yè),力推計算醫(yī)學,哲源科技用超算構建生命信息引擎

2020-04-26 09:42
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構建生命信息引擎,成就醫(yī)學界的“英特爾芯片”,賦能全臨床

“循證醫(yī)學最大的特點是體現(xiàn)了群體的特征,但是卻永遠沒辦法知道藥物對具體某個人的實際療效如何。”哲源科技COO趙宇表示,“例如在判斷腫瘤用藥方面,我們需要大約25000個基因,例如針對乳腺癌的分類和治療方案的選擇,可能就涉及三千多個基因,在目前實際場景中,如果說患者沒有標志物,那么即便是精準醫(yī)學也束手無策,最后又回歸到循證醫(yī)學! 而在計算醫(yī)學的方法論下,哲源科技不再是依賴某個單獨的基因作為判斷藥物療效的關鍵,也不局限于靶點和藥物之間的一對一單點的因果關系,而是系統(tǒng)性地看待生命,最終哲源均能夠給出用藥建議方案,用超算手段去挖掘驅(qū)動找到新重點,然后結合人工智能的方法做算法迭代輸出,去探尋整體機體體系間的相關關系,構建出一個生命信息引擎。

而訓練這個模型的數(shù)據(jù)體量,按趙宇的描述,已經(jīng)超過PB(1P=106G)量級,每次系統(tǒng)迭代都需要耗費千萬級的電費。“生命信息引擎并非‘海市蜃樓’,我們已經(jīng)有部分成果在臨床上獲得了佐證!壁w宇告訴動脈網(wǎng)。

就在最近,哲源科技通過生命信息引擎的子系統(tǒng)TWIRLS分析了世界上有關冠狀病毒的1.4萬多篇文獻相關文本資料共計300萬余單詞,在沒有任何臨床資源情況下,四小時就找到了新冠病毒導致“細胞因子風暴”的潛在機制,進而明確指出一個治療的新靶點。

無獨有偶,一個月后,這一計算醫(yī)學方法下的“紙上談兵”的研究結論,在3月25日Research Square平臺的一項由上海瑞金醫(yī)院病理科教授王朝夫、中國科學院院士卞修武等為通訊作者的論文中得以驗證。更在其后中國醫(yī)學科學院蔣澄宇團隊以及武漢大學基礎醫(yī)學院李紅良團隊分別回顧性研究中進一步驗證。

生命信息引擎可以生動地理解為醫(yī)學界的“英特爾芯片”,理論上可以為全醫(yī)療領域的各類細分疾病進行數(shù)字化模擬試藥,即便面對棘手的癌癥,計算醫(yī)學呈現(xiàn)出巨大的優(yōu)勢。

腫瘤之所以難以治愈,原因在于癌癥并非由單一的基因控制,而是由上萬基因共同作用的結果,這些基因還會在體內(nèi)突變、演化,并且都不是“孤軍奮戰(zhàn)”,相反他們作為通路形成“種群”,聯(lián)合去完成特定任務。攻克癌癥,就好比要去解析一個超級復雜的電子路線圖,試圖通過單基因的管控實現(xiàn)全癌癥治療難度可想而知。

圖.jpg

BBC紀錄中將癌癥信號通路形容成“你見過的最復雜的電子路線圖”

哲源科技通過機器學習模型深度解讀腫瘤基因組全局性變異,評估腫瘤信號通路的激活狀態(tài),可對腫瘤進行分期、評估原發(fā)灶起源、預測腫瘤進展等情況,輔助醫(yī)生與患者選擇靶向藥物、化療藥物、免疫治療藥物,評估用藥療效。特別是針對一線及多線用藥失敗、基因檢測無可用藥提示、檢測到用藥變異但臨床效果不好、發(fā)生耐藥等腫瘤臨床疑難問題,為醫(yī)生提供可用藥方案、輔助優(yōu)化后續(xù)臨床治療方案,實現(xiàn)腫瘤全程精準診療。

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