AI如何發(fā)現(xiàn)新機(jī)制特發(fā)性肺纖維化藥物?
藥物研發(fā)是人工智能最重要和最大的應(yīng)用場(chǎng)景之一。
本文為IPO早知道原創(chuàng)作者|Stone Jin
據(jù)IPO早知道消息,Insilico Medicine于2月24日宣布——首次將生物學(xué)和化學(xué)生成學(xué)相結(jié)合,發(fā)現(xiàn)一種全新機(jī)制的用于治療特發(fā)性肺纖維化(IPF)的臨床候選新藥,并成功通過(guò)多次人類細(xì)胞和動(dòng)物模型實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。
鑒于IPF牽涉多種疾病,影響多個(gè)器官(肺、肝和腎),這一新藥的出現(xiàn)意味著有望解決影響全球成千上萬(wàn)人的廣泛的未被滿足的醫(yī)療需求。
IPF病因至今未明,醫(yī)學(xué)界尚不清楚其發(fā)病機(jī)制,且該病多為散發(fā),患者從出現(xiàn)癥狀到死亡,平均存活年限不超過(guò)5年。
廣泛的肺纖維化容易并發(fā)肺癌,晚期也會(huì)出現(xiàn)肺動(dòng)脈高壓,F(xiàn)用于治療IPF的藥物已在臨床使用30多年,僅對(duì)10%~30%的病人有療效;颊咴诩膊⊥砥诳垦醑熖岣呱尜|(zhì)量,但情況不容樂觀。
Insilico Medicine創(chuàng)始人兼首席執(zhí)行官Alex Zhavoronkov博士表示:“將正確的藥物靶點(diǎn)與正確的疾病聯(lián)系起來(lái)是藥物研發(fā)的最大挑戰(zhàn)”,“隨著今天我們實(shí)現(xiàn)第一個(gè)人工智能發(fā)現(xiàn)和科學(xué)驗(yàn)證臨床前候選藥物(PCC)的里程碑,Insilico攻克了藥物發(fā)現(xiàn)中的又一大障礙,并突破了傳統(tǒng)藥物發(fā)現(xiàn)過(guò)程中的另一瓶頸,這一過(guò)程花費(fèi)了非常少的成本和時(shí)間。”
AI改寫藥物發(fā)現(xiàn)
從靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)到臨床前候選藥物的發(fā)明,Insilico僅用時(shí)不到18個(gè)月,就實(shí)現(xiàn)了靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)、分子生成和通過(guò)傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,動(dòng)物體內(nèi)IPF療效確認(rèn)及安全性評(píng)估,總成本約為180萬(wàn)美元,其他纖維化疾病療效研究總成本約為80萬(wàn)美元,合成和測(cè)試了不超過(guò)80個(gè)小分子化合物。
傳統(tǒng)的藥物發(fā)現(xiàn)首先是對(duì)數(shù)萬(wàn)個(gè)小分子進(jìn)行測(cè)試篩選,然后進(jìn)一步合成和測(cè)試數(shù)百個(gè)分子,以便得到少數(shù)幾個(gè)適合臨床前研究的候選藥物,其中只有大約1/10的候選藥物能夠最終通過(guò)人類患者的臨床試驗(yàn)。整個(gè)過(guò)程緩慢且成本昂貴,平均耗時(shí)10年,花費(fèi)十?dāng)?shù)億美元。
另一個(gè)進(jìn)一步阻礙新藥推向市場(chǎng)的障礙是,整個(gè)研發(fā)過(guò)程涉及的大量研發(fā)步驟—每一階段花費(fèi)數(shù)百至數(shù)千萬(wàn)美元—往往是由藥物研發(fā)行業(yè)中不同公司或不同的業(yè)務(wù)部門分散進(jìn)行的。
Zhavoronkov博士表示:“我們正在改寫藥物發(fā)現(xiàn)的歷史,成為首個(gè)、也是唯一一個(gè)以人工智能為驅(qū)動(dòng)的藥物發(fā)現(xiàn)集成系統(tǒng)的開創(chuàng)者和領(lǐng)導(dǎo)者”,“通過(guò)創(chuàng)建首個(gè)通用系統(tǒng),將藥物開發(fā)的所有領(lǐng)域從靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)、小分子化合物設(shè)計(jì)以及將來(lái)的臨床試驗(yàn)結(jié)果預(yù)測(cè)聯(lián)系起來(lái),Insilico的人工智能平臺(tái)將能夠支持藥物研發(fā)的每一階段的發(fā)展!
AI如何發(fā)現(xiàn)新機(jī)制特發(fā)性肺纖維化藥物
Insilico Medicine從通過(guò)人工智能發(fā)現(xiàn)的20個(gè)與纖維化相關(guān)的全新潛在靶點(diǎn)開始研究,將適應(yīng)癥范圍逐步縮小到專門針對(duì)IPF的一個(gè)新靶點(diǎn)。
靶點(diǎn)確定后,Insilico通過(guò)人工智能化學(xué)生成系統(tǒng)設(shè)計(jì)了一組新的化合物來(lái)選擇性地抑制這個(gè)新靶點(diǎn)。這些分子必須具備良好的選擇性、生物利用度、代謝穩(wěn)定性、口服給藥性質(zhì)、安全性,及藥物特有的多個(gè)優(yōu)質(zhì)屬性。這些分子最初是由公司的生成化學(xué)人工智能系統(tǒng)Chemistry42其中的基于結(jié)構(gòu)的分子設(shè)計(jì)算法產(chǎn)生的,并且顯示在細(xì)胞實(shí)驗(yàn)和動(dòng)物模型實(shí)驗(yàn)的有效性。
這些實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)隨后反饋給人工智能系統(tǒng),人工智能再次設(shè)計(jì)新一批的化合物優(yōu)化活性及成藥性,并再次驗(yàn)證。
經(jīng)過(guò)數(shù)輪設(shè)計(jì)-合成-評(píng)估-優(yōu)化-重新設(shè)計(jì)循環(huán)后,目前已經(jīng)確定了臨床前候選化合物。Insilico的臨床前候選化合物通過(guò)了公司內(nèi)部和外部纖維化疾病領(lǐng)域?qū)<业膰?yán)格評(píng)估,已進(jìn)入臨床前研究階段。
此外,Insilico還通過(guò)人工智能預(yù)測(cè)此IPF新靶點(diǎn)、新分子的二期臨床試驗(yàn)成功機(jī)率很高。Insilico目前正在進(jìn)行IND申報(bào)實(shí)驗(yàn),目標(biāo)是在2022年初進(jìn)行臨床研究。
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