華西醫(yī)院、華為、賽樂基因聯(lián)合發(fā)布“多組學(xué)數(shù)據(jù)加速分析平臺”
9月28日,在“四川大學(xué)125周年校慶活動暨第七屆生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)·智能技術(shù)應(yīng)用峰會”開幕式上,四川大學(xué)華西醫(yī)院、華為技術(shù)有限公司、賽樂基因科技(北京)有限公司聯(lián)合發(fā)布多組學(xué)數(shù)據(jù)加速分析平臺,該平臺基于GPU加速,集數(shù)據(jù)存儲、計算、管理、使用為一體,旨在推動基因測序技術(shù)創(chuàng)新,加速醫(yī)療行業(yè)數(shù)字化轉(zhuǎn)型。
華西醫(yī)院、華為、賽樂基因聯(lián)合發(fā)布“多組學(xué)數(shù)據(jù)加速分析平臺”
目前,基于該平臺已經(jīng)取得重大階段性進(jìn)展:30X人類WGS胚系變異分析時間從24小時縮短至7分鐘,這是全球首次將人類全基因組分析推進(jìn)至分鐘級時代,在多組學(xué)數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域具有跨時代的意義。
隨著新一代基因測序技術(shù)(Next Generation Sequencing,NGS)和測序儀的發(fā)展,基因測序速度不斷提升,測序成本不斷下降,人類全基因組的測序成本從過去的30億美金已經(jīng)下降到500美金,由此帶來了基因相關(guān)科學(xué)研究和應(yīng)用的快速發(fā)展,目前基因測序技術(shù)已經(jīng)在生育健康、腫瘤個體化診斷和治療、遺傳病、傳染病檢測、疫苗研發(fā)等領(lǐng)域獲得廣泛的應(yīng)用,為精準(zhǔn)醫(yī)療和個性化醫(yī)療帶來眾多革命性創(chuàng)新。
與基因行業(yè)的快速爆發(fā)相對應(yīng),基因測序數(shù)據(jù)則呈現(xiàn)指數(shù)級增長趨勢,未來有可能比肩天文數(shù)據(jù)量。當(dāng)前每臺最先進(jìn)的基因測序儀每天產(chǎn)生的測序數(shù)據(jù)已經(jīng)達(dá)到6TB,每年產(chǎn)生的數(shù)據(jù)則高達(dá)數(shù)十PB,且需要永久保存。為了及時分析這些海量的基因數(shù)據(jù),測序企業(yè)和科研機(jī)構(gòu)往往需要投入高額資金建設(shè)高性能計算集群和數(shù)據(jù)中心。因此,基因數(shù)據(jù)的分析速度與成本日益成為掣肘基因測序行業(yè)發(fā)展的關(guān)鍵因素。如何提升基因數(shù)據(jù)的分析效率、降低成本投入成為業(yè)內(nèi)公認(rèn)必須解決的新課題。
此次三方創(chuàng)新合作,充分發(fā)揮了華西醫(yī)院在多模態(tài)組學(xué)數(shù)據(jù)分析和基因應(yīng)用等領(lǐng)域的領(lǐng)先學(xué)術(shù)和產(chǎn)業(yè)優(yōu)勢,華為公司在高性能數(shù)據(jù)存儲和先進(jìn)基因數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)上的技術(shù)積累,以及賽樂基因在GPU加速生物信息數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域的行業(yè)經(jīng)驗。面向未來,三方的創(chuàng)新合作有望在基因測序領(lǐng)域,以數(shù)據(jù)為驅(qū)動,以創(chuàng)新為引擎,加速數(shù)據(jù)與存儲技術(shù)賦能生物科技產(chǎn)業(yè),促進(jìn)甚至引領(lǐng)醫(yī)療行業(yè)的數(shù)字化變革。
華西醫(yī)院數(shù)據(jù)科學(xué)家于浩澎博士發(fā)表演講
“多組學(xué)大數(shù)據(jù)時代已經(jīng)到來,華西醫(yī)院多組學(xué)數(shù)據(jù)加速分析平臺創(chuàng)新性地引入華為OceanStor Pacific面向多樣化算力的融合分析數(shù)據(jù)底座,以及賽樂基因BaseNumber基因數(shù)據(jù)分析GPU加速方案,推動多組學(xué)數(shù)據(jù)分析邁入分鐘級時代!比A西醫(yī)院數(shù)據(jù)科學(xué)家于浩澎博士在下午的演講中提到,“此項研究成果的發(fā)布,將加速精準(zhǔn)醫(yī)療大數(shù)據(jù)在醫(yī)學(xué)上的廣泛應(yīng)用。”
華西醫(yī)院作為醫(yī)學(xué)科研機(jī)構(gòu)的龍頭,深刻理解醫(yī)療行業(yè)業(yè)務(wù)需求,賽樂基因在基因數(shù)據(jù)分析技術(shù)領(lǐng)域深耕多年,華為公司則能提供最好的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)設(shè)施平臺。此次ICT技術(shù)與生命科學(xué)的融合創(chuàng)新,將加速智慧醫(yī)療產(chǎn)業(yè)發(fā)展,為未來的基因科學(xué)做出貢獻(xiàn),促進(jìn)人類的健康福祉。
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