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嗜熱厭氧菌Thermoanaerobacter kivui利用二氧化碳,將甘露醇轉(zhuǎn)化為同型乙酸

01

文章背景簡介  

BACKGROUND INTRODUCTION

不久之前,中科院天津工業(yè)生物技術(shù)研究所的科研人員們,成功的利用二氧化碳合成了淀粉,使人們對(duì)于二氧化碳在合成生物學(xué)中的應(yīng)用價(jià)值,產(chǎn)生了更高的關(guān)注與期待。

產(chǎn)乙酸微生物可以利用有機(jī)底物,如糖、氫氣(H2)、二氧化碳(CO2)。嗜熱產(chǎn)乙酸的厭氧微生物Thermoanaerobacter kivui是少數(shù)利用甘露醇的產(chǎn)乙酸微生物之一,這一過程依賴于編碼甘露醇吸收、磷酸化和甘露醇-1-磷酸氧化為果糖-6-磷酸的基因簇。

大多數(shù)產(chǎn)乙酸菌以C6糖(例如:葡萄糖和甘露醇)為基質(zhì)異養(yǎng)生長:

葡萄糖產(chǎn)乙酸:C6H12O6 + 2H2O→ 2CH3COOH + 2CO2 + 8[H](1)

2CO2 + 8[H]→ CH3COOH + 2H2O(2)

C6H12O6→ 3CH3COOH(3)

甘露醇產(chǎn)乙酸:C6H14O6 + 2H2O→ 2CH3COOH + 2CO2 + 10[H](4)

甘露醇是褐藻中一種豐富的儲(chǔ)備碳水化合物,那當(dāng)?shù)孜餅楦事洞紩r(shí),是如何代謝的呢?且甘露醇發(fā)酵相對(duì)于葡萄糖多產(chǎn)生了兩個(gè)[H],那么兩個(gè)電子去了哪里?在產(chǎn)乙酸菌轉(zhuǎn)化甘露醇的過程中,電子要么沉積在糖氧化的中間產(chǎn)物上、產(chǎn)生比乙酸更還原的產(chǎn)物,要么沉積在外部電子受體上。

Wood-Ljungdahl通路(WLP) 是一種古老的碳固定通路。一些厭氧微生物如產(chǎn)乙酸菌、產(chǎn)甲烷菌等主要通過 Wood-Ljungdahl通路, 依靠 CO/CO2和氫氣為碳源和能源, 合成乙酰輔酶A, 進(jìn)行物質(zhì)和能量代謝。Wood-Ljungdahl通路廣泛存在于厭氧細(xì)菌和古細(xì)菌中, 用于合成代謝和分解代謝。然而,甘露醇氧化與WLP的耦合尚未在任何產(chǎn)乙酸菌中詳細(xì)研究。

2020年11月,來自德國法蘭克福約翰沃爾夫?qū)璧麓髮W(xué)的Jimyung Moon等在《Front Microbiol》(IF=4.235,生物二區(qū)微生物學(xué)二區(qū))發(fā)表了題為“Homoacetogenic conversion of mannitol by the thermophilic acetogenic bacterium Thermoanaerobacter kivui requires external CO2”的文章。作者通過各種條件下生長細(xì)胞和細(xì)胞懸浮液的生理實(shí)驗(yàn),提出了厭氧微生物Thermoanaerobacter kivui中甘露醇的代謝模型。對(duì)磷酸轉(zhuǎn)移酶系統(tǒng)攝取甘露醇和通過耐高溫甘露醇-1-磷酸脫氫酶轉(zhuǎn)化甘露醇-1-磷酸進(jìn)行了研究,包括三種主要的氫化酶,以解釋[H]如何在糖酵解過程中生成乙酸或乙酸+H2。研究發(fā)現(xiàn),T. kivui在生長和轉(zhuǎn)化甘露醇的過程中,是利用外部CO2作為額外的電子受體。

02

所用到的主要方法

METHODS  

高效液相色譜法(HPLC)

氣相色譜法(GC)

微生物生長曲線繪制

靜息細(xì)胞實(shí)驗(yàn)

基質(zhì)減少和產(chǎn)物形成分析

03

文章主要內(nèi)容摘要

ABSTRACT

T.kivui休眠細(xì)胞和生長細(xì)胞的實(shí)驗(yàn)表明,在有HCO3?的條件下,甘露醇以同型乙酸的方式“發(fā)酵”被快速消耗,即乙酸是唯一的產(chǎn)物,且乙酸與甘露醇的比例高于3;在無HCO3?的培養(yǎng)條件下,每個(gè)甘露醇產(chǎn)生的乙酸比例顯著降低,孵育3小時(shí)后,加入HCO3?,甘露醇的消耗和乙酸的生成再次加快。根據(jù)前述方程式,多余的2個(gè)轉(zhuǎn)移到NAD+的電子又去了哪里?理論上可能是生成副產(chǎn)物,但實(shí)驗(yàn)證實(shí)雖然有乳酸、乙醇產(chǎn)生但過于微量、可忽略不計(jì),那電子就只能轉(zhuǎn)移到了CO2,才會(huì)出現(xiàn)甘露醇完全被消耗,乙酸產(chǎn)生過量的現(xiàn)象。由此證明甘露醇氧化產(chǎn)生的額外電子被引導(dǎo)到WLP中以固定CO2,即甘露醇可以利用CO2產(chǎn)生乙酸,4C6H14O6 + 2C+4O2→ 13C-3H3C+3OO? + 13H+ + 2H2O;

在沒有CO2的培養(yǎng)基中,質(zhì)子被還原為H2,但甘露醇的轉(zhuǎn)化顯著降低,細(xì)胞生長速度慢了2.5倍。然而,當(dāng)加入甲酸鹽后,與存在CO2/HCO3?的環(huán)境下觀察到的生長行為相對(duì)應(yīng),且實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)外界的甲酸鹽完全取代了外部的CO2/HCO3?,是唯一添加的電子受體。利用除CO2以外的電子受體的能力,增強(qiáng)了在沒有或很少CO2存在的環(huán)境中或在不斷變化的環(huán)境條件下產(chǎn)乙酸菌的代謝靈活性。


       原文標(biāo)題 : 嗜熱厭氧菌Thermoanaerobacter kivui利用二氧化碳,將甘露醇轉(zhuǎn)化為同型乙酸

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